Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
PRDM2Q13029 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
PRDM2Q13029 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
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