Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HSPB3Q12988 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms