Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TROQ12816 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TROQ12816 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TROQ12816 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TROQ12816 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TROQ12816 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TROQ12816 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TROQ12816 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TROQ12816 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TROQ12816 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TROQ12816 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TROQ12816 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TROQ12816 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TROQ12816 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TROQ12816 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TROQ12816 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TROQ12816 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TROQ12816 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TROQ12816 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TROQ12816 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TROQ12816 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TROQ12816 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TROQ12816 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TROQ12816 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TROQ12816 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TROQ12816 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TROQ12816 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TROQ12816 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TROQ12816 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TROQ12816 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TROQ12816 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TROQ12816 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TROQ12816 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TROQ12816 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TROQ12816 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TROQ12816 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TROQ12816 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TROQ12816 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TROQ12816 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TROQ12816 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TROQ12816 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TROQ12816 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TROQ12816 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TROQ12816 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TROQ12816 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TROQ12816 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TROQ12816 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TROQ12816 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TROQ12816 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TROQ12816 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TROQ12816 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TROQ12816 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
TROQ12816 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TROQ12816 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TROQ12816 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TROQ12816 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TROQ12816 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TROQ12816 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TROQ12816 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TROQ12816 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TROQ12816 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TROQ12816 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TROQ12816 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TROQ12816 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TROQ12816 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TROQ12816 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TROQ12816 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TROQ12816 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TROQ12816 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
TROQ12816 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
TROQ12816 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TROQ12816 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TROQ12816 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TROQ12816 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TROQ12816 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TROQ12816 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TROQ12816 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
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