Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC173Q0VFZ6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms