Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CGNL1Q0VF96 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CGNL1Q0VF96 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms