Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GABPAQ06546 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms