Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DEUP1Q05D60 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DEUP1Q05D60 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms