Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNB3Q05901 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNB3Q05901 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms