Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CENPCQ03188 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CENPCQ03188 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms