Protein–RNA interactions for Protein: Q02985

CFHR3, Complement factor H-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR3Q02985 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CFHR3Q02985 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CFHR3Q02985 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CFHR3Q02985 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR3Q02985 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR3Q02985 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR3Q02985 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR3Q02985 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR3Q02985 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR3Q02985 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR3Q02985 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR3Q02985 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CFHR3Q02985 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CFHR3Q02985 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CFHR3Q02985 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CFHR3Q02985 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CFHR3Q02985 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR3Q02985 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR3Q02985 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR3Q02985 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR3Q02985 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR3Q02985 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR3Q02985 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR3Q02985 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR3Q02985 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR3Q02985 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR3Q02985 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR3Q02985 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR3Q02985 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CFHR3Q02985 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR3Q02985 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR3Q02985 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR3Q02985 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR3Q02985 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR3Q02985 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CFHR3Q02985 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR3Q02985 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CFHR3Q02985 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms