Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
POU5F1Q01860 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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POU5F1Q01860 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
POU5F1Q01860 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms