Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
OTUD4Q01804 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
OTUD4Q01804 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms