Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NFKB2Q00653 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NFKB2Q00653 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms