Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TFAMQ00059 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TFAMQ00059 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms