Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUCB2P80303 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms