Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX6P78412 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX6P78412 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX6P78412 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX6P78412 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX6P78412 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX6P78412 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IRX6P78412 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IRX6P78412 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX6P78412 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX6P78412 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX6P78412 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX6P78412 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX6P78412 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX6P78412 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX6P78412 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX6P78412 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX6P78412 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX6P78412 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX6P78412 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX6P78412 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX6P78412 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX6P78412 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IRX6P78412 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX6P78412 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX6P78412 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX6P78412 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX6P78412 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX6P78412 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX6P78412 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX6P78412 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX6P78412 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX6P78412 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX6P78412 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX6P78412 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IRX6P78412 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IRX6P78412 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IRX6P78412 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IRX6P78412 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX6P78412 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX6P78412 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX6P78412 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX6P78412 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX6P78412 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX6P78412 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX6P78412 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX6P78412 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX6P78412 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX6P78412 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX6P78412 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX6P78412 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX6P78412 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX6P78412 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX6P78412 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX6P78412 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX6P78412 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX6P78412 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX6P78412 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IRX6P78412 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX6P78412 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX6P78412 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX6P78412 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX6P78412 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX6P78412 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX6P78412 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX6P78412 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX6P78412 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX6P78412 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX6P78412 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX6P78412 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX6P78412 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX6P78412 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX6P78412 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX6P78412 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX6P78412 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX6P78412 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IRX6P78412 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms