Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACTA1P68133 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTA1P68133 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms