Protein–RNA interactions for Protein: P68032

ACTC1, Actin, alpha cardiac muscle 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTC1P68032 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ACTC1P68032 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ACTC1P68032 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms