Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPNP63162 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPNP63162 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms