Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO4P61968 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO4P61968 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO4P61968 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO4P61968 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO4P61968 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO4P61968 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO4P61968 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO4P61968 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO4P61968 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO4P61968 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO4P61968 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO4P61968 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO4P61968 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO4P61968 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LMO4P61968 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMO4P61968 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMO4P61968 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMO4P61968 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LMO4P61968 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO4P61968 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO4P61968 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO4P61968 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO4P61968 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO4P61968 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO4P61968 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO4P61968 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO4P61968 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO4P61968 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO4P61968 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO4P61968 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO4P61968 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO4P61968 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO4P61968 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO4P61968 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO4P61968 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO4P61968 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO4P61968 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO4P61968 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO4P61968 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LMO4P61968 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LMO4P61968 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LMO4P61968 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms