Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NUP107P57740 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NUP107P57740 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP107P57740 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP107P57740 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP107P57740 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP107P57740 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP107P57740 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP107P57740 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP107P57740 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP107P57740 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP107P57740 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP107P57740 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP107P57740 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP107P57740 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP107P57740 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP107P57740 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP107P57740 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP107P57740 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP107P57740 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP107P57740 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP107P57740 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP107P57740 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP107P57740 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NUP107P57740 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUP107P57740 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUP107P57740 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NUP107P57740 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NUP107P57740 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP107P57740 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP107P57740 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP107P57740 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP107P57740 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP107P57740 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP107P57740 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP107P57740 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP107P57740 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP107P57740 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP107P57740 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP107P57740 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP107P57740 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP107P57740 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP107P57740 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP107P57740 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUP107P57740 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms