Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GFRA1P56159 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GFRA1P56159 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms