Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP12AP54707 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ATP12AP54707 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms