Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CACNB3P54284 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB3P54284 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms