Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CASP4P49662 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP4P49662 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP4P49662 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP4P49662 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP4P49662 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP4P49662 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP4P49662 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP4P49662 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP4P49662 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP4P49662 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP4P49662 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP4P49662 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP4P49662 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CASP4P49662 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASP4P49662 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASP4P49662 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CASP4P49662 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP4P49662 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP4P49662 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP4P49662 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP4P49662 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP4P49662 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP4P49662 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP4P49662 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP4P49662 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP4P49662 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP4P49662 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP4P49662 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP4P49662 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP4P49662 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CASP4P49662 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP4P49662 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP4P49662 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP4P49662 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP4P49662 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP4P49662 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP4P49662 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP4P49662 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP4P49662 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP4P49662 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP4P49662 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP4P49662 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP4P49662 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP4P49662 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP4P49662 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP4P49662 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CASP4P49662 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP4P49662 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP4P49662 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP4P49662 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP4P49662 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP4P49662 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CASP4P49662 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP4P49662 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP4P49662 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP4P49662 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP4P49662 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP4P49662 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP4P49662 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP4P49662 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP4P49662 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP4P49662 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP4P49662 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP4P49662 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP4P49662 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP4P49662 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP4P49662 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP4P49662 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP4P49662 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP4P49662 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP4P49662 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP4P49662 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP4P49662 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP4P49662 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP4P49662 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CASP4P49662 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP4P49662 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP4P49662 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP4P49662 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP4P49662 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP4P49662 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP4P49662 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP4P49662 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP4P49662 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CASP4P49662 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms