Protein–RNA interactions for Protein: P49279

SLC11A1, Natural resistance-associated macrophage protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC11A1P49279 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SLC11A1P49279 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms