Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NEDD4P46934 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NEDD4P46934 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms