Protein–RNA interactions for Protein: P41595

HTR2B, 5-hydroxytryptamine receptor 2B, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2BP41595 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2BP41595 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms