Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP62P37198 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP62P37198 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP62P37198 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP62P37198 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP62P37198 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP62P37198 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP62P37198 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP62P37198 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP62P37198 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP62P37198 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP62P37198 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP62P37198 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP62P37198 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP62P37198 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP62P37198 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP62P37198 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP62P37198 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP62P37198 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP62P37198 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NUP62P37198 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NUP62P37198 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP62P37198 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP62P37198 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP62P37198 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP62P37198 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP62P37198 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP62P37198 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP62P37198 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP62P37198 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP62P37198 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NUP62P37198 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP62P37198 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP62P37198 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP62P37198 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP62P37198 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP62P37198 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP62P37198 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP62P37198 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP62P37198 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP62P37198 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP62P37198 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP62P37198 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP62P37198 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP62P37198 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP62P37198 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NUP62P37198 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NUP62P37198 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms