Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TRIM23P36406 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms