Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DDIT3P35638 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms