Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HOXD12P35452 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HOXD12P35452 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms