Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GPC1P35052 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPC1P35052 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPC1P35052 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPC1P35052 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPC1P35052 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPC1P35052 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPC1P35052 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPC1P35052 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPC1P35052 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GPC1P35052 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GPC1P35052 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GPC1P35052 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms