Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA10P31260 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXA10P31260 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms