Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CLIP1P30622 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms