Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
HTR2AP28223 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms