Protein–RNA interactions for Protein: P26599

PTBP1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP1P26599 IGFL2-AS1-203ENST00000598518 1037 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.174e-7■■■■■ 30
PTBP1P26599 IGFL2-AS1-202ENST00000595673 304 ntTSL 37.06□□□□□ -1.284e-7■■■■■ 30
PTBP1P26599 C20orf196-203ENST00000442185 627 ntTSL 35.33□□□□□ -1.569e-14■■■■■ 30
PTBP1P26599 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.644e-7■■■■■ 30
PTBP1P26599 C20orf196-204ENST00000445603 501 ntTSL 34.36□□□□□ -1.719e-14■■■■■ 30
PTBP1P26599 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.822e-6■■■■■ 30
PTBP1P26599 KIAA0753-201ENST00000361413 4859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.212e-6■■■■■ 30
PTBP1P26599 KIAA0753-207ENST00000572370 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.462e-6■■■■■ 30
PTBP1P26599 KIAA0753-204ENST00000570790 3403 ntTSL 24.68□□□□□ -1.662e-6■■■■■ 30
PTBP1P26599 CTNNA1-230ENST00000521724 2741 ntTSL 29.16□□□□□ -0.941e-6■■■■■ 30
PTBP1P26599 CTNNA1-210ENST00000518825 3536 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.161e-6■■■■■ 30
PTBP1P26599 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.341e-6■■■■■ 30
PTBP1P26599 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 30
PTBP1P26599 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.839e-7■■■■■ 30
PTBP1P26599 L3MBTL4-202ENST00000400104 4534 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.944e-7■■■■■ 30
PTBP1P26599 JMJD1C-205ENST00000469152 734 ntTSL 33.62□□□□□ -1.832e-7■■■■■ 30
PTBP1P26599 JMJD1C-207ENST00000489372 913 ntTSL 53.48□□□□□ -1.852e-7■■■■■ 30
PTBP1P26599 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.942e-7■■■■■ 30
PTBP1P26599 JMJD1C-203ENST00000402544 8011 ntTSL 1 (best)2.15□□□□□ -2.062e-7■■■■■ 30
PTBP1P26599 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 30
PTBP1P26599 GTPBP10-204ENST00000417207 775 ntTSL 57.06□□□□□ -1.284e-7■■■■■ 30
PTBP1P26599 GTPBP10-207ENST00000439832 545 ntTSL 26.51□□□□□ -1.374e-7■■■■■ 30
PTBP1P26599 GTPBP10-202ENST00000257659 1740 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.394e-7■■■■■ 30
PTBP1P26599 GTPBP10-209ENST00000453512 636 ntTSL 56.02□□□□□ -1.454e-7■■■■■ 30
PTBP1P26599 GTPBP10-205ENST00000421719 686 ntTSL 56.02□□□□□ -1.454e-7■■■■■ 30
PTBP1P26599 GTPBP10-203ENST00000380058 6913 ntTSL 1 (best)5.95□□□□□ -1.464e-7■■■■■ 30
PTBP1P26599 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.554e-7■■■■■ 30
PTBP1P26599 GTPBP10-211ENST00000474503 715 ntTSL 55.27□□□□□ -1.574e-7■■■■■ 30
PTBP1P26599 GTPBP10-208ENST00000450619 856 ntTSL 54.26□□□□□ -1.734e-7■■■■■ 30
PTBP1P26599 GTPBP10-206ENST00000426366 778 ntTSL 54.09□□□□□ -1.754e-7■■■■■ 30
PTBP1P26599 ANKRD28-214ENST00000498713 1091 ntTSL 25.58□□□□□ -1.529e-9■■■■■ 30
PTBP1P26599 ANKRD28-212ENST00000497037 3509 ntTSL 24.21□□□□□ -1.749e-9■■■■■ 30
PTBP1P26599 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.829e-9■■■■■ 30
PTBP1P26599 CCDC136-215ENST00000528772 565 ntTSL 49.27□□□□□ -0.931e-7■■■■■ 30
PTBP1P26599 C10orf88-201ENST00000368891 2991 ntTSL 212.94□□□□□ -0.343e-8■■■■■ 30
PTBP1P26599 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.383e-8■■■■■ 30
PTBP1P26599 CPNE3-212ENST00000621783 817 ntTSL 59.06□□□□□ -0.963e-8■■■■■ 30
PTBP1P26599 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.393e-8■■■■■ 30
PTBP1P26599 CPNE3-202ENST00000517391 785 ntTSL 34.12□□□□□ -1.753e-8■■■■■ 30
PTBP1P26599 C10orf88-203ENST00000470158 675 ntTSL 33.95□□□□□ -1.783e-8■■■■■ 30
PTBP1P26599 SMYD3-205ENST00000453676 562 ntTSL 43.2□□□□□ -1.93e-7■■■■■ 29.9
PTBP1P26599 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.58e-7■■■■■ 29.9
PTBP1P26599 USP6NL-202ENST00000379237 4546 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.758e-7■■■■■ 29.9
PTBP1P26599 WDR70-201ENST00000265107 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.593e-8■■■■■ 29.9
PTBP1P26599 WDR70-207ENST00000511906 5716 ntTSL 25.08□□□□□ -1.63e-8■■■■■ 29.9
PTBP1P26599 PPP1R12B-204ENST00000391959 15431 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.123e-6■■■■■ 29.9
PTBP1P26599 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.253e-6■■■■■ 29.9
PTBP1P26599 NAV2-204ENST00000396087 7882 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.569e-7■■■■■ 29.9
PTBP1P26599 NAV2-201ENST00000349880 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.739e-7■■■■■ 29.9
PTBP1P26599 NAV2-208ENST00000527559 11171 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.829e-7■■■■■ 29.9
PTBP1P26599 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.139e-7■■■■■ 29.9
PTBP1P26599 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.179e-7■■■■■ 29.9
PTBP1P26599 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.219e-7■■■■■ 29.9
PTBP1P26599 SMYD3-216ENST00000492487 634 ntTSL 36.94□□□□□ -1.33e-7■■■■■ 29.9
PTBP1P26599 RHOBTB3-205ENST00000504949 1511 ntTSL 29.96□□□□□ -0.827e-8■■■■■ 29.9
PTBP1P26599 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 29.9
PTBP1P26599 ABHD2-205ENST00000565066 845 ntTSL 512.51□□□□□ -0.412e-6■■■■■ 29.9
PTBP1P26599 ABHD2-201ENST00000352732 8735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 29.9
PTBP1P26599 ABHD2-209ENST00000569411 558 ntTSL 58.7□□□□□ -1.022e-6■■■■■ 29.9
PTBP1P26599 ABHD2-202ENST00000562073 588 ntTSL 56.78□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 29.9
PTBP1P26599 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.721e-17■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.721e-17■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 PTGER3-211ENST00000497146 1971 ntTSL 1 (best)19.34■□□□□ 0.691e-17■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 PTGER3-210ENST00000479353 1895 ntTSL 1 (best)18.46■□□□□ 0.551e-17■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 PTGER3-205ENST00000361210 1922 ntTSL 1 (best)17.9■□□□□ 0.461e-17■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.451e-17■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.311e-17■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.191e-17■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.061e-17■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.031e-17■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.231e-17■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 PTGER3-206ENST00000370924 6982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.721e-17■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.326e-8■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.586e-8■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.516e-8■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.46e-8■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 ADAP1-204ENST00000446141 2085 ntTSL 217.52■□□□□ 0.46e-8■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.336e-8■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 ADAP1-203ENST00000437486 622 ntTSL 515.34■□□□□ 0.056e-8■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 COX19-202ENST00000457254 1420 ntTSL 212.9□□□□□ -0.346e-8■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 ADAP1-213ENST00000488527 584 ntTSL 511.87□□□□□ -0.516e-8■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 ADAP1-209ENST00000463358 595 ntTSL 311.34□□□□□ -0.596e-8■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 ADAP1-202ENST00000435943 559 ntTSL 511.1□□□□□ -0.636e-8■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 ADAP1-207ENST00000453823 560 ntTSL 49.64□□□□□ -0.876e-8■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 ADAP1-208ENST00000454383 576 ntTSL 49.47□□□□□ -0.896e-8■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 ADAP1-210ENST00000477906 579 ntTSL 39.1□□□□□ -0.956e-8■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 CPE-204ENST00000511992 563 ntTSL 55.66□□□□□ -1.53e-8■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 CPE-202ENST00000431967 633 ntTSL 45.35□□□□□ -1.553e-8■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.831e-9■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.086e-8■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.496e-8■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 GRIN2A-215ENST00000637393 833 ntTSL 310.24□□□□□ -0.776e-8■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 GRIN2A-202ENST00000396573 14450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.176e-8■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 PPP1R12B-214ENST00000491336 2046 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 PPP1R12B-201ENST00000290419 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.542e-10■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.59e-12■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 29.8
PTBP1P26599 MEGF8-203ENST00000378073 11034 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.734e-7■■■■■ 29.8
Retrieved 100 of 27,725 protein–RNA pairs in 180.5 ms