Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NFKBIAP25963 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms