Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTSSP25774 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTSSP25774 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTSSP25774 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSSP25774 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSSP25774 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSSP25774 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSSP25774 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSSP25774 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSSP25774 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSSP25774 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSSP25774 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSSP25774 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSSP25774 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSSP25774 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSSP25774 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSSP25774 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSSP25774 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CTSSP25774 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSSP25774 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSSP25774 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSSP25774 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSSP25774 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CTSSP25774 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms