Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
PRKCHP24723 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PRKCHP24723 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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