Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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