Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
HRCP23327 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HRCP23327 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HRCP23327 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HRCP23327 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HRCP23327 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HRCP23327 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HRCP23327 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HRCP23327 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HRCP23327 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HRCP23327 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HRCP23327 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
HRCP23327 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HRCP23327 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HRCP23327 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HRCP23327 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HRCP23327 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HRCP23327 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HRCP23327 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HRCP23327 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HRCP23327 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HRCP23327 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HRCP23327 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HRCP23327 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HRCP23327 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HRCP23327 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
HRCP23327 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HRCP23327 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HRCP23327 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HRCP23327 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HRCP23327 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HRCP23327 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HRCP23327 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HRCP23327 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
HRCP23327 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HRCP23327 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HRCP23327 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HRCP23327 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HRCP23327 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HRCP23327 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HRCP23327 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HRCP23327 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HRCP23327 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HRCP23327 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HRCP23327 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HRCP23327 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HRCP23327 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
HRCP23327 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HRCP23327 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HRCP23327 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HRCP23327 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HRCP23327 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
HRCP23327 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HRCP23327 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HRCP23327 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HRCP23327 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HRCP23327 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HRCP23327 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
HRCP23327 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HRCP23327 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HRCP23327 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HRCP23327 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HRCP23327 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HRCP23327 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HRCP23327 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HRCP23327 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HRCP23327 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HRCP23327 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HRCP23327 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HRCP23327 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HRCP23327 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HRCP23327 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HRCP23327 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
HRCP23327 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms