Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCL3P20749 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCL3P20749 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCL3P20749 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCL3P20749 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCL3P20749 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BCL3P20749 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BCL3P20749 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BCL3P20749 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BCL3P20749 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms