Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPI1P17947 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPI1P17947 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPI1P17947 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPI1P17947 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPI1P17947 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPI1P17947 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SPI1P17947 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SPI1P17947 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SPI1P17947 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms