Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTLA4P16410 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTLA4P16410 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms