Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA1P15085 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA1P15085 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA1P15085 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA1P15085 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA1P15085 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPA1P15085 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPA1P15085 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA1P15085 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA1P15085 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA1P15085 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA1P15085 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA1P15085 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA1P15085 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA1P15085 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA1P15085 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA1P15085 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA1P15085 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA1P15085 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA1P15085 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA1P15085 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA1P15085 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPA1P15085 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPA1P15085 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPA1P15085 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPA1P15085 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPA1P15085 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA1P15085 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA1P15085 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA1P15085 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA1P15085 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA1P15085 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA1P15085 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA1P15085 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA1P15085 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA1P15085 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA1P15085 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA1P15085 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA1P15085 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPA1P15085 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA1P15085 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA1P15085 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA1P15085 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA1P15085 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA1P15085 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA1P15085 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA1P15085 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA1P15085 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA1P15085 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA1P15085 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA1P15085 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA1P15085 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA1P15085 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA1P15085 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA1P15085 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA1P15085 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA1P15085 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA1P15085 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA1P15085 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA1P15085 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA1P15085 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA1P15085 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPA1P15085 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA1P15085 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA1P15085 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA1P15085 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA1P15085 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA1P15085 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA1P15085 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA1P15085 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA1P15085 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA1P15085 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPA1P15085 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms