Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GABRA1P14867 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms