Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GP1BBP13224 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms