Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYL1P12980 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYL1P12980 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYL1P12980 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYL1P12980 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYL1P12980 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYL1P12980 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYL1P12980 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYL1P12980 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYL1P12980 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LYL1P12980 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYL1P12980 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYL1P12980 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYL1P12980 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LYL1P12980 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYL1P12980 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYL1P12980 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYL1P12980 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYL1P12980 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYL1P12980 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYL1P12980 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYL1P12980 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LYL1P12980 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LYL1P12980 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LYL1P12980 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms