Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COX6A1P12074 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COX6A1P12074 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms